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  • 1032 ChIP-seq等揭示熱休克轉(zhuǎn)錄因子A1b調(diào)控植物高溫脅迫響應(yīng)的分子機制 2023-4-24
    在擬南芥中,熱休克轉(zhuǎn)錄因子A1b(HEAT SHOCK TRANSCRIPTION FACTORA1b,HSFA1b)通過影響種子產(chǎn)量來調(diào)控對環(huán)境脅迫的抗性。HSFA1b是生殖適應(yīng)性的決定性因素,這種調(diào)控機制怎么形成的呢?2018年,

  • 1091 高通量測序后的下游實驗驗證方法之ChIP-seq介紹 2023-3-28
    此前,我們分享了染色質(zhì)免疫共沉淀測序(ChIP-seq)的數(shù)據(jù)挖掘思路,進而篩選出TF結(jié)合/組蛋白修飾的目標區(qū)域和候選靶基因。做完ChIP-seq測序后,如果需要對分析結(jié)果中感興趣的內(nèi)容進行后期驗證,

  • 1382 染色質(zhì)免疫共沉淀測序(ChIP-seq)的數(shù)據(jù)挖掘思路 2023-3-27
    CHIP-seq研究的數(shù)據(jù)挖掘思路主要分為3步:1. 整體把握CHIP-seq圖譜特征:peak/reads在基因組上的分布、peak在元件上的富集、peak在基因元件上的分布、peak的motif分析、peak距離TSS位點的距離分

  • 339 次 DAP-seq技術(shù)助力胡楊耐鹽機制的研究 2020-4-21
    2019年9月,北京林業(yè)大學和藍景科信合作,在植物學主流學術(shù)期刊Journal of Experimental Botany上(IF=5.36),發(fā)表了題為“Populus euphratica WRKY1 binds the promoter of H+-ATPase

  • 5044 國自然研究熱點—eccDNA的前世今生 2020-3-18
    ​1. eccDNA為什么火?它到底是何方神圣?2019年11月,頂尖國際學術(shù)期刊《Nature》和《Cell》相繼發(fā)表了關(guān)于染色體外環(huán)狀DNA(extrachromosomal circular DNA,eccDNA)的重要研究,徹底顛覆

  • 3651 揭秘m6A修飾新功能 -- 調(diào)控染色質(zhì)狀態(tài)和轉(zhuǎn)錄活性 2020-1-20
    文章導讀m6A是真核生物中最常見的一類化學修飾,能夠在多種生物過程中發(fā)揮重要作用,包括癌癥發(fā)生發(fā)展、細胞分化、壓力應(yīng)答、免疫反應(yīng)以及神經(jīng)發(fā)育等方面。目前大部分研究主要探究m6A對蛋白編碼

  • 2679 新型超微量染色質(zhì)免疫共沉淀ChIP-seq技術(shù)-Cut&Tag 2020-1-12
    文章導讀染色質(zhì)免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation , ChIP)是研究蛋白質(zhì)與DNA互作的標準方法。通過與高通量測序技術(shù)相結(jié)合,研究者開發(fā)了ChIP-seq技術(shù),從而獲得全基因組范圍內(nèi)與組蛋白

  • 5578 circRNA再發(fā)IF=18.88高分文章--circRNA機制研究匯總 2019-4-18
    circRNA再發(fā)IF=18.88高分文章--您想知道的circRNA機制研究,都在這兒……文章導讀超強子調(diào)控circRNA-Nfix缺失誘導成年小鼠心肌梗死后再生circRNAs正在成為心臟發(fā)育和疾病強有力的調(diào)

  • 4120 ChIP-seq&mRNA-seq在外周淋巴瘤的藥物聯(lián)用實驗中的應(yīng)用 2018-2-28
    上海交通大學附屬瑞金醫(yī)院血液研究所趙維蒞教授團隊針對外周淋巴瘤的研究。近期,該課題組應(yīng)用ChIP-seq聯(lián)合分析揭示了聯(lián)用西達本胺和地西他濱對組蛋白修飾基因突變的外周淋巴瘤的作用機制。該研

  • 2148 探究轉(zhuǎn)錄因子對于hESC代謝調(diào)控新機制研究 2016-12-26
    ESC在體外可無限自我更新和分化為機體內(nèi)任何種類的細胞,在器官再生和細胞替代治療中具有廣闊的應(yīng)用前景。然而,hESC維持自我更新及發(fā)育多能性的分子調(diào)控機制還有很多問題尚不清楚,妨礙了將其分

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