新一代測(cè)序技術(shù)揭示一種I 型糖尿病與腸道病毒感染相關(guān)的遺傳變異
研究顯示一種疾病相關(guān)的抗病毒應(yīng)答基因的罕見(jiàn)突變能降低罹患I 型糖尿病的風(fēng)險(xiǎn)。3 月5 日《Science》雜志在線公布的一項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)，某種疾病相關(guān)基因的一組罕見(jiàn)突變可以降低罹患I 型糖尿�。═1D）的風(fēng)險(xiǎn)。這項(xiàng)研究由劍橋大學(xué)WellcomeTrust/JDRF 糖尿病與炎癥實(shí)驗(yàn)室的Nejentsev 等人完成。他們利用羅氏旗下454 生命科學(xué)公司的Genome Sequencer FLX 系統(tǒng)對(duì)10 個(gè)候選基因進(jìn)行了深度的重測(cè)序，這些基因還包括之前通過(guò)對(duì)I 型糖尿�。═1D）的全基因組關(guān)聯(lián)研究（GWAS）所識(shí)別的基因。I 型糖尿病是一種常見(jiàn)的自身免疫紊亂疾病，會(huì)導(dǎo)致生成胰島素的胰臟細(xì)胞損傷。這項(xiàng)研究提出了I 型糖尿病遺傳機(jī)制新見(jiàn)解，也是首次直接從之前進(jìn)行的全基因組關(guān)聯(lián)研究（GWAS）研究結(jié)果中發(fā)現(xiàn)許多保護(hù)性T1D 等位基因。這一發(fā)現(xiàn)和先進(jìn)的科學(xué)方法為未來(lái)發(fā)展出更好的檢測(cè)、治療和預(yù)防I 型糖尿�。═1D）以及其它遺傳疾病的方法提供了參考。
I 型糖尿病是一種高度復(fù)雜、多因素影響的疾病，也就意味著超過(guò)一種以上的遺傳因素結(jié)合環(huán)境條件，共同參與疾病成因。至今為止，全基因組關(guān)聯(lián)研究識(shí)別出了15 個(gè)與I 型糖尿病有關(guān)的基因位點(diǎn)。雖然全基因組關(guān)聯(lián)研究廣泛用于常見(jiàn)人類(lèi)疾病的相關(guān)基因組區(qū)域作圖，但是這種方法并不能識(shí)別出臨床應(yīng)用所必需的明確的致病基因和序列差異，因此為了進(jìn)一步檢驗(yàn)這些T1D 位點(diǎn)，這項(xiàng)研究的研究人員挑選了10 個(gè)基因，對(duì)來(lái)自英國(guó)的480 個(gè)I 型糖尿病病患和480 個(gè)健康對(duì)照個(gè)體中的DNA 進(jìn)行了超深測(cè)序（ultra-deep sequencing）。結(jié)果他們從中發(fā)現(xiàn)了179 個(gè)罕見(jiàn)的單核苷酸多態(tài)性SNPs。進(jìn)一步研究通過(guò)對(duì)超過(guò)30000 個(gè)I 型糖尿病病人，對(duì)照和家族成員的DNA 等位基因頻率進(jìn)行比較，從而檢測(cè)這些SNP 與疾病的相關(guān)性。研究人員最終確定了
IFIH1 基因上4 個(gè)從統(tǒng)計(jì)學(xué)角度上與疾病明確相關(guān)的罕見(jiàn)SNPs。令人驚訝的是研究結(jié)果表明，這些罕見(jiàn)的突變能很有效的降低I 型糖尿病風(fēng)險(xiǎn)，這也就是說(shuō)IFIH1 多態(tài)性相關(guān)的罕見(jiàn)等位基因能降低I 型糖尿病風(fēng)險(xiǎn)，而多數(shù)人攜帶的IFIH1 等位基因則屬于I 型糖尿病的易感基因。
文章通訊作者John Todd 博士解釋道，“這些新研究結(jié)果說(shuō)明IFIH1-MDA5 基因作為成因促進(jìn)了I 型糖尿病的發(fā)生，同時(shí)也指出了一種從目前大量的潛在候選基因中識(shí)別出更多I 型糖尿病特異基因的方法”，“雖然這些結(jié)果只是管中窺豹，但是這項(xiàng)研究是一項(xiàng)重要的發(fā)現(xiàn)�！�
有趣的是研究人員發(fā)現(xiàn)罕見(jiàn)突變的這種保護(hù)性作用對(duì)于研究IFIH1 蛋白的生物學(xué)功能也有意義。這種蛋白，即MDA5，能識(shí)別細(xì)小病毒（Picornaviruses）中的RNA，介導(dǎo)機(jī)體免疫活化。相對(duì)于一般群體，新診斷I 型糖尿病患者和糖尿病前期患者比普通人更易感染腸道病毒，比如柯薩奇病毒（coxsackie）、脊髓灰質(zhì)炎病毒（polioviruses）和�？刹《荆‥choviruses），以及所有細(xì)小病毒家族成員。雖然IFIH1 基因?qū)τ诩膊顟B(tài)的影響機(jī)制仍然需要深入研究，但是研究人員推測(cè)這些突變能影響轉(zhuǎn)錄剪接（transcript splicing），截?cái)嗷虮磉_(dá)產(chǎn)物。這說(shuō)明，這些據(jù)推測(cè)會(huì)降低IFIH1 蛋白功能的突變可降低罹患I 型糖尿病的風(fēng)險(xiǎn)，而正�；虻墓δ軇t與疾病正相關(guān)。文章第一作者Sergey Nejentsev 博士表示，“發(fā)現(xiàn)這幾種生物學(xué)功能明確的罕見(jiàn)疾病突變的意義重大。研究不僅證實(shí)了IFIH1 與I 型糖尿病有關(guān)，而且為我們提供了解其機(jī)制的線索”
采用454 深度測(cè)序擴(kuò)增子可高靈敏檢測(cè)罕見(jiàn)突變，頻率低至1％的等位基因群也可以檢出，這種方法已經(jīng)被應(yīng)用于針對(duì)各種不同復(fù)雜疾病的類(lèi)似的研究中。454 生命科學(xué)公司技術(shù)總監(jiān)，Michael Egholm 表示，“我們很高興看到454 測(cè)序技術(shù)用于這種轉(zhuǎn)化型研究（translational research）”，“在這項(xiàng)研究中運(yùn)用的這種方法鑒別出了真正成因性的突變和保護(hù)性的突變，而使保護(hù)性的突變有望成為未來(lái)檢測(cè)、治療和預(yù)防I 型
糖尿病以及其它疾病的潛在靶標(biāo)，這將GWAS 獲得信息能力推向了一個(gè)新水平。”454 生命科學(xué)是羅氏應(yīng)用科學(xué)旗下卓越的中心之一，開(kāi)發(fā)并商業(yè)化了創(chuàng)新的454 測(cè)序系統(tǒng)，用于超高通量的DNA 測(cè)序。具體的應(yīng)用包括基因組的從頭測(cè)序和重測(cè)序、宏基因組學(xué)、RNA 分析和DNA 目標(biāo)區(qū)域的定向測(cè)序。454 測(cè)序系統(tǒng)的特點(diǎn)是樣品制備簡(jiǎn)單且無(wú)偏向性，讀長(zhǎng)包括配對(duì)末端讀長(zhǎng)超長(zhǎng)且準(zhǔn)確度高。454 測(cè)序系統(tǒng)的技術(shù)已經(jīng)催生了各個(gè)研究領(lǐng)域的幾百項(xiàng)經(jīng)同行評(píng)議的研究，例如癌癥和傳染病研究、藥物篩選、海洋生物學(xué)、人類(lèi)學(xué)、古生物學(xué)等多個(gè)方面。更多信息，請(qǐng)查看http:///。
I 型糖尿病是一種高度復(fù)雜、多因素影響的疾病，也就意味著超過(guò)一種以上的遺傳因素結(jié)合環(huán)境條件，共同參與疾病成因。至今為止，全基因組關(guān)聯(lián)研究識(shí)別出了15 個(gè)與I 型糖尿病有關(guān)的基因位點(diǎn)。雖然全基因組關(guān)聯(lián)研究廣泛用于常見(jiàn)人類(lèi)疾病的相關(guān)基因組區(qū)域作圖，但是這種方法并不能識(shí)別出臨床應(yīng)用所必需的明確的致病基因和序列差異，因此為了進(jìn)一步檢驗(yàn)這些T1D 位點(diǎn)，這項(xiàng)研究的研究人員挑選了10 個(gè)基因，對(duì)來(lái)自英國(guó)的480 個(gè)I 型糖尿病病患和480 個(gè)健康對(duì)照個(gè)體中的DNA 進(jìn)行了超深測(cè)序（ultra-deep sequencing）。結(jié)果他們從中發(fā)現(xiàn)了179 個(gè)罕見(jiàn)的單核苷酸多態(tài)性SNPs。進(jìn)一步研究通過(guò)對(duì)超過(guò)30000 個(gè)I 型糖尿病病人，對(duì)照和家族成員的DNA 等位基因頻率進(jìn)行比較，從而檢測(cè)這些SNP 與疾病的相關(guān)性。研究人員最終確定了
IFIH1 基因上4 個(gè)從統(tǒng)計(jì)學(xué)角度上與疾病明確相關(guān)的罕見(jiàn)SNPs。令人驚訝的是研究結(jié)果表明，這些罕見(jiàn)的突變能很有效的降低I 型糖尿病風(fēng)險(xiǎn)，這也就是說(shuō)IFIH1 多態(tài)性相關(guān)的罕見(jiàn)等位基因能降低I 型糖尿病風(fēng)險(xiǎn)，而多數(shù)人攜帶的IFIH1 等位基因則屬于I 型糖尿病的易感基因。
文章通訊作者John Todd 博士解釋道，“這些新研究結(jié)果說(shuō)明IFIH1-MDA5 基因作為成因促進(jìn)了I 型糖尿病的發(fā)生，同時(shí)也指出了一種從目前大量的潛在候選基因中識(shí)別出更多I 型糖尿病特異基因的方法”，“雖然這些結(jié)果只是管中窺豹，但是這項(xiàng)研究是一項(xiàng)重要的發(fā)現(xiàn)�！�
有趣的是研究人員發(fā)現(xiàn)罕見(jiàn)突變的這種保護(hù)性作用對(duì)于研究IFIH1 蛋白的生物學(xué)功能也有意義。這種蛋白，即MDA5，能識(shí)別細(xì)小病毒（Picornaviruses）中的RNA，介導(dǎo)機(jī)體免疫活化。相對(duì)于一般群體，新診斷I 型糖尿病患者和糖尿病前期患者比普通人更易感染腸道病毒，比如柯薩奇病毒（coxsackie）、脊髓灰質(zhì)炎病毒（polioviruses）和�？刹《荆‥choviruses），以及所有細(xì)小病毒家族成員。雖然IFIH1 基因?qū)τ诩膊顟B(tài)的影響機(jī)制仍然需要深入研究，但是研究人員推測(cè)這些突變能影響轉(zhuǎn)錄剪接（transcript splicing），截?cái)嗷虮磉_(dá)產(chǎn)物。這說(shuō)明，這些據(jù)推測(cè)會(huì)降低IFIH1 蛋白功能的突變可降低罹患I 型糖尿病的風(fēng)險(xiǎn)，而正�；虻墓δ軇t與疾病正相關(guān)。文章第一作者Sergey Nejentsev 博士表示，“發(fā)現(xiàn)這幾種生物學(xué)功能明確的罕見(jiàn)疾病突變的意義重大。研究不僅證實(shí)了IFIH1 與I 型糖尿病有關(guān)，而且為我們提供了解其機(jī)制的線索”
采用454 深度測(cè)序擴(kuò)增子可高靈敏檢測(cè)罕見(jiàn)突變，頻率低至1％的等位基因群也可以檢出，這種方法已經(jīng)被應(yīng)用于針對(duì)各種不同復(fù)雜疾病的類(lèi)似的研究中。454 生命科學(xué)公司技術(shù)總監(jiān)，Michael Egholm 表示，“我們很高興看到454 測(cè)序技術(shù)用于這種轉(zhuǎn)化型研究（translational research）”，“在這項(xiàng)研究中運(yùn)用的這種方法鑒別出了真正成因性的突變和保護(hù)性的突變，而使保護(hù)性的突變有望成為未來(lái)檢測(cè)、治療和預(yù)防I 型
糖尿病以及其它疾病的潛在靶標(biāo)，這將GWAS 獲得信息能力推向了一個(gè)新水平。”454 生命科學(xué)是羅氏應(yīng)用科學(xué)旗下卓越的中心之一，開(kāi)發(fā)并商業(yè)化了創(chuàng)新的454 測(cè)序系統(tǒng)，用于超高通量的DNA 測(cè)序。具體的應(yīng)用包括基因組的從頭測(cè)序和重測(cè)序、宏基因組學(xué)、RNA 分析和DNA 目標(biāo)區(qū)域的定向測(cè)序。454 測(cè)序系統(tǒng)的特點(diǎn)是樣品制備簡(jiǎn)單且無(wú)偏向性，讀長(zhǎng)包括配對(duì)末端讀長(zhǎng)超長(zhǎng)且準(zhǔn)確度高。454 測(cè)序系統(tǒng)的技術(shù)已經(jīng)催生了各個(gè)研究領(lǐng)域的幾百項(xiàng)經(jīng)同行評(píng)議的研究，例如癌癥和傳染病研究、藥物篩選、海洋生物學(xué)、人類(lèi)學(xué)、古生物學(xué)等多個(gè)方面。更多信息，請(qǐng)查看http:///。
- 美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院宣布停止對(duì)僅動(dòng)物研究的資助
- 智聽(tīng)自然，聲動(dòng)未來(lái)：沃德精準(zhǔn)亮相"聲景中國(guó)"研討會(huì)
- 百蓁生物推出一站式高精度HDX-MS分析服務(wù)
- 10x Chromium GEM-X動(dòng)物及畜牧類(lèi)研究獎(jiǎng)勵(lì)計(jì)劃啟動(dòng)
- 生物芯片空間多組學(xué)平臺(tái)再添一臺(tái)CosMx SMI成像系統(tǒng)
- PicoQuant顯微鏡助力開(kāi)發(fā)高效單光子發(fā)射源二維材料
- 安捷倫與北師大共建大灣區(qū)污水流行病學(xué)聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室
- 客戶(hù)專(zhuān)訪：RAYPA培養(yǎng)基制備器使用心得與經(jīng)驗(yàn)分享
- 赫西儀器參與起草國(guó)標(biāo)《實(shí)驗(yàn)室離心機(jī)》條例
- Biotech DEGASi®脫氣腔助力水性液體高效脫氣
- 祝賀BMG斬獲SelectScience科學(xué)家選擇獎(jiǎng)行業(yè)殊榮
- 合作成果：全球首次展示微重力環(huán)境下高通量篩選力
- 政企同心奧豪斯向薛家鎮(zhèn)幼教集團(tuán)捐贈(zèng)儀式圓滿(mǎn)舉行
- 中科都菱北京經(jīng)銷(xiāo)渠道合作共創(chuàng)會(huì)圓滿(mǎn)落幕
- 易科泰PhenoTron-PTS 多光譜成像平臺(tái)落戶(hù)華南師大
- 2025伯豪生物春季全國(guó)巡講開(kāi)啟，早鳥(niǎo)報(bào)名搶占先機(jī)
- 華大智造副總裁中國(guó)區(qū)總經(jīng)理彭歡歡一行到訪伯豪生物
- 伯豪董事長(zhǎng)出席專(zhuān)精特新中小企業(yè)發(fā)展壯大論壇并發(fā)言
- 伯豪生物雙11狂歡特惠活動(dòng)來(lái)襲，限時(shí)限量搶
- 怡美通德推出成本價(jià)體驗(yàn)單細(xì)胞測(cè)序（FFPE或全血）
- 伯豪生物2024系列培訓(xùn)班（陜西站）報(bào)名開(kāi)啟
- 伯豪單細(xì)胞Flex年中巨惠，1.1W/樣本活動(dòng)價(jià)即將截止
- 藍(lán)景科信DAP-seq技術(shù)相關(guān)文章6連發(fā)，總IF 95.2
- 伯豪生物2024單細(xì)胞空轉(zhuǎn)生信培訓(xùn)8月直播課開(kāi)啟報(bào)名
- 中生柏奧成為德國(guó)LenioBio中國(guó)區(qū)合作伙伴
- 伯豪生物與騰云生物達(dá)成戰(zhàn)略合作共推科技服務(wù)新發(fā)展
- 云平臺(tái)賦能，伯豪單細(xì)胞分析云流程正式上線
- 伯豪生物直播預(yù)告：?jiǎn)渭?xì)胞技術(shù)在臨床科研中的應(yīng)用
- 伯豪生物空間轉(zhuǎn)錄組&Olink蛋白質(zhì)組多重優(yōu)惠限時(shí)促銷(xiāo)
- 伯豪直播：?jiǎn)渭?xì)胞RNA測(cè)序腎病機(jī)制研究與生信云實(shí)操
Copyright(C) 1998-2025 生物器材網(wǎng) 電話：021-64166852;13621656896 E-mail：info@bio-equip.com