English | 中文版 | 手機(jī)版 企業(yè)登錄 | 個(gè)人登錄 | 郵件訂閱
當(dāng)前位置 > 首頁(yè) > 行業(yè)資訊 > 新聞 > 新一代測(cè)序技術(shù)揭示一種I 型糖尿病與腸道病毒感染相關(guān)的遺傳變異

新一代測(cè)序技術(shù)揭示一種I 型糖尿病與腸道病毒感染相關(guān)的遺傳變異

瀏覽次數(shù):3662 發(fā)布日期:2009-3-5  來(lái)源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處
研究顯示一種疾病相關(guān)的抗病毒應(yīng)答基因的罕見(jiàn)突變能降低罹患I 型糖尿病的風(fēng)險(xiǎn)。3 月5 日《Science》雜志在線公布的一項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn),某種疾病相關(guān)基因的一組罕見(jiàn)突變可以降低罹患I 型糖尿。═1D)的風(fēng)險(xiǎn)。這項(xiàng)研究由劍橋大學(xué)WellcomeTrust/JDRF 糖尿病與炎癥實(shí)驗(yàn)室的Nejentsev 等人完成。他們利用羅氏旗下454 生命科學(xué)公司的Genome Sequencer FLX 系統(tǒng)對(duì)10 個(gè)候選基因進(jìn)行了深度的重測(cè)序,這些基因還包括之前通過(guò)對(duì)I 型糖尿。═1D)的全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)所識(shí)別的基因。I 型糖尿病是一種常見(jiàn)的自身免疫紊亂疾病,會(huì)導(dǎo)致生成胰島素的胰臟細(xì)胞損傷。這項(xiàng)研究提出了I 型糖尿病遺傳機(jī)制新見(jiàn)解,也是首次直接從之前進(jìn)行的全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)研究結(jié)果中發(fā)現(xiàn)許多保護(hù)性T1D 等位基因。這一發(fā)現(xiàn)和先進(jìn)的科學(xué)方法為未來(lái)發(fā)展出更好的檢測(cè)、治療和預(yù)防I 型糖尿。═1D)以及其它遺傳疾病的方法提供了參考。

I 型糖尿病是一種高度復(fù)雜、多因素影響的疾病,也就意味著超過(guò)一種以上的遺傳因素結(jié)合環(huán)境條件,共同參與疾病成因。至今為止,全基因組關(guān)聯(lián)研究識(shí)別出了15 個(gè)與I 型糖尿病有關(guān)的基因位點(diǎn)。雖然全基因組關(guān)聯(lián)研究廣泛用于常見(jiàn)人類(lèi)疾病的相關(guān)基因組區(qū)域作圖,但是這種方法并不能識(shí)別出臨床應(yīng)用所必需的明確的致病基因和序列差異,因此為了進(jìn)一步檢驗(yàn)這些T1D 位點(diǎn),這項(xiàng)研究的研究人員挑選了10 個(gè)基因,對(duì)來(lái)自英國(guó)的480 個(gè)I 型糖尿病病患和480 個(gè)健康對(duì)照個(gè)體中的DNA 進(jìn)行了超深測(cè)序(ultra-deep sequencing)。結(jié)果他們從中發(fā)現(xiàn)了179 個(gè)罕見(jiàn)的單核苷酸多態(tài)性SNPs。進(jìn)一步研究通過(guò)對(duì)超過(guò)30000 個(gè)I 型糖尿病病人,對(duì)照和家族成員的DNA 等位基因頻率進(jìn)行比較,從而檢測(cè)這些SNP 與疾病的相關(guān)性。研究人員最終確定了
IFIH1 基因上4 個(gè)從統(tǒng)計(jì)學(xué)角度上與疾病明確相關(guān)的罕見(jiàn)SNPs。令人驚訝的是研究結(jié)果表明,這些罕見(jiàn)的突變能很有效的降低I 型糖尿病風(fēng)險(xiǎn),這也就是說(shuō)IFIH1 多態(tài)性相關(guān)的罕見(jiàn)等位基因能降低I 型糖尿病風(fēng)險(xiǎn),而多數(shù)人攜帶的IFIH1 等位基因則屬于I 型糖尿病的易感基因。

文章通訊作者John Todd 博士解釋道,“這些新研究結(jié)果說(shuō)明IFIH1-MDA5 基因作為成因促進(jìn)了I 型糖尿病的發(fā)生,同時(shí)也指出了一種從目前大量的潛在候選基因中識(shí)別出更多I 型糖尿病特異基因的方法”,“雖然這些結(jié)果只是管中窺豹,但是這項(xiàng)研究是一項(xiàng)重要的發(fā)現(xiàn)!

有趣的是研究人員發(fā)現(xiàn)罕見(jiàn)突變的這種保護(hù)性作用對(duì)于研究IFIH1 蛋白的生物學(xué)功能也有意義。這種蛋白,即MDA5,能識(shí)別細(xì)小病毒(Picornaviruses)中的RNA,介導(dǎo)機(jī)體免疫活化。相對(duì)于一般群體,新診斷I 型糖尿病患者和糖尿病前期患者比普通人更易感染腸道病毒,比如柯薩奇病毒(coxsackie)、脊髓灰質(zhì)炎病毒(polioviruses)和?刹《荆‥choviruses),以及所有細(xì)小病毒家族成員。雖然IFIH1 基因?qū)τ诩膊顟B(tài)的影響機(jī)制仍然需要深入研究,但是研究人員推測(cè)這些突變能影響轉(zhuǎn)錄剪接(transcript splicing),截?cái)嗷虮磉_(dá)產(chǎn)物。這說(shuō)明,這些據(jù)推測(cè)會(huì)降低IFIH1 蛋白功能的突變可降低罹患I 型糖尿病的風(fēng)險(xiǎn),而正;虻墓δ軇t與疾病正相關(guān)。文章第一作者Sergey Nejentsev 博士表示,“發(fā)現(xiàn)這幾種生物學(xué)功能明確的罕見(jiàn)疾病突變的意義重大。研究不僅證實(shí)了IFIH1 與I 型糖尿病有關(guān),而且為我們提供了解其機(jī)制的線索”

采用454 深度測(cè)序擴(kuò)增子可高靈敏檢測(cè)罕見(jiàn)突變,頻率低至1%的等位基因群也可以檢出,這種方法已經(jīng)被應(yīng)用于針對(duì)各種不同復(fù)雜疾病的類(lèi)似的研究中。454 生命科學(xué)公司技術(shù)總監(jiān),Michael Egholm 表示,“我們很高興看到454 測(cè)序技術(shù)用于這種轉(zhuǎn)化型研究(translational research)”,“在這項(xiàng)研究中運(yùn)用的這種方法鑒別出了真正成因性的突變和保護(hù)性的突變,而使保護(hù)性的突變有望成為未來(lái)檢測(cè)、治療和預(yù)防I 型
糖尿病以及其它疾病的潛在靶標(biāo),這將GWAS 獲得信息能力推向了一個(gè)新水平。”454 生命科學(xué)是羅氏應(yīng)用科學(xué)旗下卓越的中心之一,開(kāi)發(fā)并商業(yè)化了創(chuàng)新的454 測(cè)序系統(tǒng),用于超高通量的DNA 測(cè)序。具體的應(yīng)用包括基因組的從頭測(cè)序和重測(cè)序、宏基因組學(xué)、RNA 分析和DNA 目標(biāo)區(qū)域的定向測(cè)序。454 測(cè)序系統(tǒng)的特點(diǎn)是樣品制備簡(jiǎn)單且無(wú)偏向性,讀長(zhǎng)包括配對(duì)末端讀長(zhǎng)超長(zhǎng)且準(zhǔn)確度高。454 測(cè)序系統(tǒng)的技術(shù)已經(jīng)催生了各個(gè)研究領(lǐng)域的幾百項(xiàng)經(jīng)同行評(píng)議的研究,例如癌癥和傳染病研究、藥物篩選、海洋生物學(xué)、人類(lèi)學(xué)、古生物學(xué)等多個(gè)方面。更多信息,請(qǐng)查看http:///。


用戶(hù)名: 密碼: 匿名 快速注冊(cè) 忘記密碼
評(píng)論只代表網(wǎng)友觀點(diǎn),不代表本站觀點(diǎn)。 請(qǐng)輸入驗(yàn)證碼: 8795
Copyright(C) 1998-2025 生物器材網(wǎng) 電話:021-64166852;13621656896 E-mail:info@bio-equip.com