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新加坡基因組研究院聯(lián)合羅氏研究甲型H1N1流感病毒

瀏覽次數(shù):2949 發(fā)布日期:2009-6-28  來源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處

新加坡基因組研究院聯(lián)合羅氏NimbleGen: 追蹤甲型H1N1流感病毒的進(jìn)化途徑

近期流感病毒的爆發(fā)將甲型流感新毒株(nH1N1)迅速傳播到世界各地。許多專家都在關(guān)注這種新毒株的進(jìn)化途徑,以及它是否會(huì)突變或與其它流感毒株重組產(chǎn)生更致命的毒株,如同全球曾經(jīng)歷的1918毒株。為了鑒定這些突變與重組,新加坡基因組研究院的一個(gè)研究小組已經(jīng)開發(fā)出新型的“通用”聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)方法,可擴(kuò)增任何甲型流感病毒的全基因組,然后用NimbleGen基于芯片的雜交測序,在大約24小時(shí)內(nèi)迅速通覽整個(gè)基因組(芯片讀取設(shè)備每天能讀取多達(dá)36張)。

這種新方法能利用傳統(tǒng)PCR診斷所遺留下來的相同RNA材料,在第一輪即可識(shí)別任何流感新毒株。這將有助于更快速診斷方法的開發(fā),來應(yīng)對(duì)任何可能的新變異體;它還能快速鑒定毒株的DNA是否突變,而變得更加危險(xiǎn),比如產(chǎn)生更強(qiáng)的抗藥性。

通過與羅氏NimbleGen的科學(xué)家緊密合作,并利用NimbleGen平臺(tái)所賦予的靈活性,在項(xiàng)目開始僅4天后,第一批芯片已經(jīng)設(shè)計(jì)、制造完畢并運(yùn)抵新加坡。定制開發(fā)的高密度芯片具有能從病人樣本(鼻拭子/鼻咽洗液)中揭示流感病毒完整序列的探針。它將實(shí)現(xiàn)基因組區(qū)域內(nèi)任何單堿基突變的檢測,這對(duì)藥物易感性很重要。一旦病毒發(fā)生重組,它還能鑒定出是與哪種甲型流感毒株進(jìn)行重組以及重組的基因組位點(diǎn),從而更好地了解和追蹤病毒的進(jìn)化途徑及變異體。

新加坡基因組研究院負(fù)責(zé)生物標(biāo)志物開發(fā)的首席科學(xué)家Christopher Wong博士表示:“這種新方法利用了我們?yōu)闄z測多種病原菌而開發(fā)的新型PCR技術(shù)。這將大大簡化新病毒測序的過程!

羅氏NimbleGen的首席執(zhí)行官Gerd Maass認(rèn)為:“隨著新系統(tǒng)的開發(fā),整個(gè)項(xiàng)目小組希望更好更快速地追蹤這個(gè)新流感變異體,讓世界了解病毒是如何進(jìn)化的!毙录悠禄蚪M研究院的執(zhí)行董事Edison Liu教授補(bǔ)充道:“這個(gè)追蹤過程的重要性應(yīng)被更好地利用,因?yàn)樗峁┝酥匾男畔ⅲ兄陬A(yù)防和抗?fàn)幜餍胁!?

其實(shí)利用NimbleGen芯片成功檢測突發(fā)病毒可以追溯到2003年SARS爆發(fā)期間, NimbleGen芯片采用了相似的方法成功的檢測了感染源,并全球監(jiān)控SARS病毒。

關(guān)于羅氏
羅氏始創(chuàng)于1896年,總部位于瑞士巴塞爾,在制藥和診斷領(lǐng)域是世界領(lǐng)先的以研發(fā)為基礎(chǔ)的健康事業(yè)公司之一。作為世界上最大的生物科技公司,羅氏提供從早期發(fā)現(xiàn)、預(yù)防、診斷到治療的創(chuàng)新產(chǎn)品與服務(wù),在諸多領(lǐng)域都做出了突出的貢獻(xiàn),從而提高了人類的健康水準(zhǔn)和生活質(zhì)量。羅氏是體外診斷領(lǐng)域、抗腫瘤藥品和移植藥品的全球領(lǐng)先者,是病毒學(xué)領(lǐng)域的市場領(lǐng)導(dǎo)者。在其它關(guān)鍵疾病領(lǐng)域如自身免疫性疾病、炎癥、代謝和中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病等同樣表現(xiàn)活躍。2008年,藥品部的銷售額達(dá)360億瑞士法郎,診斷部的銷售額達(dá)97億瑞士法郎。2008年,羅氏在研發(fā)方面的投入超過了90億瑞士法郎,并與多個(gè)合作伙伴建立了研究與開發(fā)的業(yè)務(wù)聯(lián)盟,包括羅氏控股的基因泰克和中外制藥。羅氏集團(tuán)共擁有約8萬名員工。如需了解更詳細(xì)的信息,請(qǐng)?jiān)L問www.roche.com。

關(guān)于羅氏NimbleGen


羅氏NimbleGen公司擁有DNA芯片、消耗品、儀器和服務(wù)等一系列專利,是領(lǐng)先的創(chuàng)新者、制造商和供應(yīng)商。羅氏NimbleGen公司生產(chǎn)長寡聚探針的高密度芯片,為研究基因組和表觀基因組變異的全部多態(tài)性,提供了更完善的信息內(nèi)容和更高的數(shù)據(jù)質(zhì)量。羅氏NimbleGen公司的專利技術(shù)Maskless Array Synthesis(MAS)用數(shù)字燈光加工和快速高效的光化學(xué),以極大的靈活性來合成長寡核苷酸、高密度DNA芯片,使得性能的提高成為現(xiàn)實(shí)。欲了解更多關(guān)于羅氏NimbleGen公司的信息,請(qǐng)?jiān)L問該公司網(wǎng)站www.nimblegen.com 。

關(guān)于新加坡基因組研究院(www.gis.a-star.edu.sg)

新加坡基因組研究院(GIS)是新加坡科技研究局(A*STAR)的成員。它是有著全球視野的國家計(jì)劃,試圖利用基因組科學(xué)來改善公眾健康和國家繁榮。新加坡基因組研究院作為基因組探索中心,成立于2001年,它將朝著個(gè)性化藥物的目標(biāo),整合技術(shù)、遺傳學(xué)和生物學(xué)。新加坡基因組研究院的核心研究領(lǐng)域包括系統(tǒng)生物學(xué)、干細(xì)胞和發(fā)育生物學(xué)、癌癥生物學(xué)及藥理學(xué)、人類遺傳學(xué)、傳染病、基因組技術(shù)以及計(jì)算和數(shù)學(xué)生物學(xué)。其基因組學(xué)基礎(chǔ)設(shè)施用于培訓(xùn)新的科技人才,為科研和工業(yè)研究搭建橋梁,并探索影響力大的科學(xué)問題。

關(guān)于新加坡科技研究局(A*STAR)(www.a-star.edu.sg)
A*STAR是新加坡的領(lǐng)導(dǎo)機(jī)構(gòu),為生機(jī)勃勃的新加坡培養(yǎng)了世界級(jí)的科學(xué)研究和人才。A*STAR積極培育了生物醫(yī)藥科學(xué)、物理學(xué)和工程學(xué)的公共部門研究與開發(fā),尤其關(guān)注對(duì)新加坡制造業(yè)和新興工業(yè)很重要的領(lǐng)域。它監(jiān)管著22個(gè)研究所、聯(lián)盟和中心,并支持與大學(xué)、醫(yī)院研究中心和其他本地及國際伙伴的對(duì)外研究。這種知識(shí)密集型工作的核心是人力資源。頂尖的本地和國際科技人才在A*STAR研究所中發(fā)揮著知識(shí)創(chuàng)造力。該局還為一流大學(xué)的本科生、研究生及博士后培訓(xùn)提供獎(jiǎng)學(xué)金,這也反映出A*STAR將培育新一代科技人才擺在最優(yōu)先的位置。

                                                           
羅氏診斷產(chǎn)品(上海)有限公司

羅氏應(yīng)用科學(xué)部 
www.roche-applied-science.com



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