Arraystar公司lncRNA芯片最新發(fā)表文章
瀏覽次數(shù):5440 發(fā)布日期:2011-6-16
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C Braconi, et al., MicroRNA-29 can regulate expression of the long non-coding RNA gene MEG3 in hepatocellular cancer. Oncogene (2011) 1–7.
研究者采用Arraystar lncRNA 芯片,比較HCC細(xì)胞株和良性人肝細(xì)胞的lncRNA表達(dá)水平,找到了在HCC細(xì)胞中表達(dá)顯著下調(diào)的lncRNA MEG3 (the maternally expressed gene-3),并進(jìn)行了實(shí)時(shí)定量PCR的驗(yàn)證。對(duì)肝癌組織和癌旁肝硬化組織的實(shí)時(shí)定量PCR實(shí)驗(yàn),以及對(duì)非腫瘤肝組織和HCC組織的ISH實(shí)驗(yàn),同樣發(fā)現(xiàn)MEG3在肝癌中的特異性表達(dá)下調(diào)。體外細(xì)胞實(shí)驗(yàn)初步研究了MEG3的腫瘤抑制功能,包括對(duì)細(xì)胞生長(zhǎng)和細(xì)胞凋亡的調(diào)控等。而對(duì)MEG3自身所受到的表達(dá)調(diào)控機(jī)制的研究,則提示MEG3的表達(dá)下調(diào)可能是因?yàn)镸EG3啟動(dòng)子發(fā)生了超甲基化,即lncRNA的表達(dá)同樣可能受到表觀(guān)遺傳調(diào)控;而MEG3啟動(dòng)子的超甲基化可能是microRNA-29a 調(diào)控通路作用的結(jié)果,從而將兩類(lèi)重要的非編碼RNA,microRNA和lncRNA聯(lián)系了起來(lái)。
表. 利用arraytar lncRNA芯片分析良性人肝細(xì)胞和4種不同HCC細(xì)胞株的lncRNA表達(dá)水平。表格中分別列出了與良性人肝細(xì)胞相比,在HCC中表達(dá)變化最大(下調(diào)或上調(diào))的10條lncRNA