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羅氏 GS Junior 測序平臺用于動物保護研究

瀏覽次數(shù):2181 發(fā)布日期:2012-3-9  來源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請注明出處
GS Junior測序平臺用于動物保護研究
 
羅氏新近與美國一國家動物園進行合作,將
Roche GS Junior測序系統(tǒng)投入到隸屬該動物園的動物保護及進化遺傳學(xué)中心的研究工作中。該中心將依靠二代測序平臺的高深度DNA測序能力,開展新的動物的疾病耐受性、群體遺傳學(xué)、 分子生態(tài)學(xué)研究。
 
該動物保護生物研究所研究重點在于深入了解物種、保護物種、培養(yǎng)物種保護學(xué)家,尤其在動物生態(tài)研究及管理、動物健康及繁殖領(lǐng)域有所專長。研究人員將利用GS  Junior測序系統(tǒng)對于威脅動物繁衍的危險致病原進行研究,項目內(nèi)容包括:
  • 獲得Chytrid Fungus的基因組圖譜,這一致死性真菌在全球范圍內(nèi)造成大量兩棲類動物死亡
  • 完成大象EEHV1(elephant endotheliotropic herpes virus)高致病性病毒株的測序
  • 繪制擴散迅速的鳥瘧(avian malaria)病毒的基因組圖譜,是夏威夷鳥類的死亡原因之一
GS Junior通量非常合適微生物基因組的研究,因此正適合上述項目的開展,而其長讀長的優(yōu)勢能很好的分辨高度變異的病毒、細菌基因組,對于病原體檢測以及病毒或細菌的比較基因組研究都非常重要。合作雙方希望通過這些項目將二代測序的巨大潛力引入到更多研究及保護地球各個物種的領(lǐng)域中,為保護生態(tài)體系做出貢獻。


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