NimbleGen SeqCap被用于加拿大大型外顯子組測序項目

瀏覽次數(shù)：3322　發(fā)布日期：2012-7-23　來源：本站　本站原創(chuàng)，轉(zhuǎn)載請注明出處

羅氏NimbleGen SeqCap用于加拿大一4000外顯子組測序項目

最近羅氏NimbleGen的SeqCap EZ Exome產(chǎn)品被加拿大多倫多一醫(yī)院基因組服務(wù)中心選中，用于一個癌癥生物標(biāo)記物研究。該中心將開展一項4000個外顯子組測序項目，用于發(fā)現(xiàn)癌癥相關(guān)的生物標(biāo)記物。

第一批購買的產(chǎn)品還包括一臺Caliper Sciclone NGS Workstation移液工作站，這個平臺將自動化、高通量地完成外顯子組序列捕獲，以及二代測序文庫制備。該實驗室希望通過建立這一SeqCap EZ Exome與二代測序結(jié)合的平臺，加強其在轉(zhuǎn)化基因組方面(translational genomics)的優(yōu)勢。除該項目外，該平臺還為Mount Sinai醫(yī)院的其他基礎(chǔ)研究實驗室以及臨床病理實驗室提供多種基因組研究服務(wù)。

NimbleGen的SeqCap產(chǎn)品獲選用于大型外顯子組測序項目已經(jīng)不是第一次。去年年末SeqCap就被選中運用于一項在荷蘭進行的大規(guī)模流行病研究項目(Rotterdam Study)，對超過3000個樣本進行外顯子組捕獲，然后用于測序。今年年初，在英國又再次被選中用于一個血液病相關(guān)研究，對50000個樣本進行外顯子組捕獲。

此次作為其后續(xù)實驗，對外顯子進行重測序。實驗中NimbleGen SeqCap液相外顯子捕獲產(chǎn)品(NimbleGen SeqCap EZ Exome Library)以及Caliper Life Sciences的自動化平臺(Sciclone NGS Workstation)將在未來的3-4個月內(nèi)完成3000多個樣本捕獲然后進行測序。

多次的成功獲選表明NimbleGen的SeqCap產(chǎn)品展現(xiàn)了其在市場上的重要地位，同時體現(xiàn)了NimbleGen高于對手的性能優(yōu)勢。同時，多個獨立進行的序列捕獲產(chǎn)品比較實驗，也發(fā)現(xiàn)了NimbleGen SeqCap EZ Exome產(chǎn)品的高定向捕獲能力以及高捕獲均一性，減少了后續(xù)所需測序量。

同時， NimbleGen SeqCap EZ成熟的自動化解決方案也實現(xiàn)對大量樣本的平行、快速、高效的序列捕獲，減少人力和縮短實驗周期，同時保證實驗的重復(fù)性、穩(wěn)定性。

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