2014屆生物信息學(xué)暑期研習(xí)班邀請(qǐng)函
2014年7月22-26日,上海海荷歐風(fēng)酒店
尊敬的老師:
您好!
上海生咨生物科技有限公司盛情邀請(qǐng)您參加2014屆生物信息學(xué)暑期研習(xí)班。本次研習(xí)班將在2014年7月22日至7月26日在上海舉辦。
本次研習(xí)班從基因組學(xué)(基因組高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析),轉(zhuǎn)錄組(RNAseq數(shù)據(jù)分析、miRNA數(shù)據(jù)分析、表達(dá)譜芯片分析)、蛋白質(zhì)組(iTRAQ數(shù)據(jù)分析)、進(jìn)化分析等多個(gè)方面講解各種組學(xué)數(shù)據(jù)的分析方法。研習(xí)班將由多年從事生物信息學(xué)分析研究的科研專家和技術(shù)工程師共同授課,通過深入淺出的理論講解和上機(jī)操作,幫助學(xué)員深入了解從基因組-轉(zhuǎn)錄組-蛋白質(zhì)組的研究思路和數(shù)據(jù)分析方法,幫助學(xué)員拓展研究思路,掌握一些數(shù)據(jù)分析的方法。
本次研習(xí)班適合:
1、零生物信息學(xué)知識(shí)但想要了解生物信息學(xué)的學(xué)員;
2、正在或者將進(jìn)行組學(xué)研究的科研人員;
3、已有組學(xué)數(shù)據(jù)需了解分析方法的研究人員;
4、想要將來從事生物信息學(xué)方向工作的學(xué)生或者工作人員。
主辦單位:上海生咨生物科技有限公司
協(xié)辦單位:上海產(chǎn)業(yè)技術(shù)研究院藥物轉(zhuǎn)化創(chuàng)新中心
支持單位:杭州谷禾信息技術(shù)有限公司
時(shí)間:2014年7月22日-2014年7月26日
地點(diǎn):海荷歐風(fēng)酒店,上海市閘北區(qū)共和新路1301號(hào)
課程安排:2014年7月22日-7月26日,報(bào)到時(shí)間2014年7月21日下午14:30- 17:30。
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時(shí)間 |
課程內(nèi)容 |
注冊(cè) |
7月21日 12:30 - 17:30
7月22日 8:30 - 9:30 |
會(huì)議注冊(cè) |
第一天(7月22日) (基礎(chǔ)知識(shí)和數(shù)據(jù)庫(kù)) |
9:30-11:45 |
生物信息學(xué)導(dǎo)論 |
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13:30-16:45 |
Linux基礎(chǔ)和軟件安裝
常用數(shù)據(jù)資源介紹(NCBI、 UCSC、UniProt等介紹) |
第二天(7月23日) (基因組測(cè)序數(shù)據(jù)分析) |
9:30-16:45 |
基因組組裝策略及方法
三代pacbio測(cè)序數(shù)據(jù)分析
基因組重測(cè)序及數(shù)據(jù)分析
微生物基因組功能注釋
真菌基因組功能注釋
上機(jī)操作:tablet,snpeff,velvet,BWA,
samtools, annovar,GATK等 |
第三天(7月24日) (轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)分析) |
9:30-16:45 |
RNAseq數(shù)據(jù)分析
miRNA數(shù)據(jù)分析
上機(jī)操作:BWA,samtools,cufflinks等 |
第四天(7月25日) (進(jìn)化分析和基因芯片) |
9:30-16:45 |
進(jìn)化分析
上機(jī)操作(clustalx,MEGA, phylip, Mrbayes等)
基于表達(dá)譜芯片的臨床數(shù)據(jù)分析
基因表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)分析及其基本處理流程 (上機(jī)操作:R分析) |
第五天 (7月26日) (蛋白質(zhì)組) |
9:30-16:45 |
蛋白質(zhì)鑒定和質(zhì)量控制
提高蛋白鑒定覆蓋度
蛋白質(zhì)搜庫(kù)上機(jī)
蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分析(GO功能分類和富集分析
通路分析,網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建)
上機(jī)操作:DAVID, Cytoscape+ BiNGO, GSEA, CateGOrizer,Cluster+Treeview,Mev,MotifX等。 |
注:
1.課程具體安排以報(bào)名當(dāng)天的課程表為準(zhǔn)。
2.應(yīng)需要上機(jī)練習(xí),請(qǐng)攜帶筆記本電腦,建議配置為4G內(nèi)存,10G空余硬盤空間。
收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)
工作人員4600元/人,在校學(xué)生4100元/人 (含資料費(fèi)和中餐)
其他優(yōu)惠:
1、同一單位2人以上參加蛋白質(zhì)組學(xué)前沿技術(shù)研習(xí)班,每人優(yōu)惠200元。
2、2014年7月5日之前匯款優(yōu)惠200元,以匯款回執(zhí)時(shí)間為準(zhǔn)。
3、上海生咨生物科技有限公司的客戶或之前參加過研討班學(xué)員推薦學(xué)員優(yōu)惠300元。
以上優(yōu)惠可同時(shí)享受。
交通住宿費(fèi)用自理,住宿預(yù)定需提前一周預(yù)定。
住宿協(xié)議酒店為海荷歐風(fēng)酒店(準(zhǔn)四星酒店)
協(xié)議價(jià): 豪華標(biāo)準(zhǔn)房280元/天(含雙早)。注:合住每人140元/天,若湊不到合住的學(xué)員需支侍全價(jià)。
豪華大床房280元/天(含雙早)。
名額有限,提前匯款學(xué)員可優(yōu)先選擇前排座位,報(bào)名后因有事無法參加的學(xué)員請(qǐng)?zhí)崆埃敝苈?lián)系我們。
點(diǎn)此下載報(bào)名回執(zhí)表
付款方式:
1. 匯款:上海生咨生物科技有限公司
開戶銀行:中國(guó)農(nóng)業(yè)銀行上海星火支行
匯款帳號(hào):03805500040008016
請(qǐng)?jiān)趨R款前與我們電話聯(lián)系,匯款后將回單電子郵件發(fā)給我們,以便我們確認(rèn),匯款請(qǐng)注明“會(huì)議”+您的姓名。
聯(lián)系人:
許丹丹(ddxu@biorefer.com; 1377122204@qq.com)
手機(jī): 189-1780-5836 座機(jī):021-31131531
QQ: 1377122204
備用聯(lián)系人:
俞鴻 (hyu@biorefer.com; 425217020@qq.com)
手機(jī):15900766827
2. 研習(xí)班報(bào)到當(dāng)天現(xiàn)金支付。
講課專家信息
李亦學(xué) 教授
上海生物信息技術(shù)研究中心主任,中科院上海生命科學(xué)研究院系統(tǒng)生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室副主任,研究員,博士生導(dǎo)師。上海生物信息學(xué)會(huì)理事長(zhǎng),中科院“十一五”信息化專家組專家。曾任國(guó)家中長(zhǎng)期發(fā)展規(guī)劃第十五專題組副組長(zhǎng),上海市2002年科學(xué)預(yù)見專家,中國(guó)科學(xué)院計(jì)劃局生命科學(xué)領(lǐng)域戰(zhàn)略發(fā)展專家組專家,國(guó)家“十五” 863計(jì)劃生物和農(nóng)業(yè)技術(shù)領(lǐng)域生物信息技術(shù)主題專家組組長(zhǎng),國(guó)家科技部中英E-Science國(guó)際合作計(jì)劃中方協(xié)調(diào)人。研究方向:蛋白質(zhì)組學(xué)研究,系統(tǒng)生物學(xué)研究。
蔡曉輝 副研究員
中國(guó)科學(xué)院上海生化細(xì)胞所獲生物信息學(xué)博士學(xué)位,畢業(yè)后先后在美國(guó)印第安娜大學(xué)計(jì)算生物學(xué)和生物信息學(xué)中心,加州大學(xué)圣地亞哥分校生物系統(tǒng)研究中心作為訪問學(xué)者從事博士后工作。2011年至今在上海生物信息技術(shù)研究中心任副研究員工作。研究方向包括蛋白質(zhì)序列、結(jié)構(gòu)與功能關(guān)系,蛋白質(zhì)重要功能位點(diǎn)的識(shí)別,蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析以及二代測(cè)序數(shù)據(jù)分析,生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)和生物信息學(xué)算法開發(fā)等。
賈佳
新加坡海歸生物信息學(xué)博士 上海生物信息技術(shù)研究中心副研究員,生命科學(xué)數(shù)據(jù)中心負(fù)責(zé)人,主要從事生物醫(yī)藥信息數(shù)據(jù)資源開發(fā)和整合技術(shù)的研究。
金谷雷
浙江大學(xué)生物信息學(xué)博士杭州谷禾信息技術(shù)有限公司 總經(jīng)理 從事生物信息研究近10年,參與了包括國(guó)家973、863計(jì)劃以及自然科學(xué)基金等項(xiàng)目。研究階段獨(dú)立研發(fā)了Biopubinfo知識(shí)網(wǎng)絡(luò)平臺(tái)。擅長(zhǎng)高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析。
徐昊
2001年起從事生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析工作,同濟(jì)大學(xué)生物工程碩士,分別在華大基因、上海生物信息技術(shù)研究中心、眾信生物技術(shù)有限公司擔(dān)任數(shù)據(jù)分析工程師職務(wù),曾獲得國(guó)家杰出科學(xué)家證書。曾經(jīng)擔(dān)任過超過10期生物信息學(xué)培訓(xùn)班講師,有豐富的培訓(xùn)經(jīng)驗(yàn)。熟悉常用數(shù)據(jù)庫(kù)以及分析軟件,生物信息學(xué)擅長(zhǎng)分析領(lǐng)域?yàn)镽NA-seq、微生物基因組分析,分析超過百個(gè)cDNA文庫(kù)和RNA-seq庫(kù),對(duì)金黃色葡萄球菌,鉤端螺旋體、黃單胞菌等做過深入分析。
于復(fù)東
博士、副研究員。
2008年1月畢業(yè)于中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院,獲生物信息學(xué)博士學(xué)位。畢業(yè)后一直從事二代測(cè)序等高通量數(shù)據(jù)分析、腫瘤基因組學(xué)、及相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)開發(fā)和分析平臺(tái)建立等生物信息學(xué)研究工作。目前主要從事腫瘤基因組學(xué)方面的研究工作,運(yùn)用系統(tǒng)生物學(xué)的方法研究可以應(yīng)用于臨床早期診斷、預(yù)后、復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移相關(guān)的分子標(biāo)志物基因及其功能等。近年來作為項(xiàng)目負(fù)責(zé)人完成了國(guó)家自然科學(xué)基金、上海市博士后基金、上海市白玉蘭科技人才基金各一項(xiàng),作為生物信息學(xué)分析平臺(tái)負(fù)責(zé)人完成傳染病重大專項(xiàng)課題一項(xiàng),作為技術(shù)骨干參與完成863計(jì)劃項(xiàng)目一項(xiàng),累積發(fā)表SCI論文十余篇。
俞鴻
現(xiàn)任上海生咨生物科技有限公司經(jīng)理,資深生物信息學(xué)工程師. 具有超過10年生物信息學(xué)分析經(jīng)驗(yàn)。參與了水稻基因組、家蠶基因組、人肝蛋白質(zhì)組計(jì)劃以及其他的國(guó)家973、863計(jì)劃及國(guó)家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目。主要從事蛋白質(zhì)組、基因組方向的分析。
會(huì)議地點(diǎn)及交通路線:
培訓(xùn)地點(diǎn):海荷歐風(fēng)酒店,共和新路1130號(hào)
●上海虹橋機(jī)場(chǎng)(二號(hào)航站樓)距離酒店30公里;乘出租車約40分鐘,約80元可到酒店。坐2號(hào)地鐵到人民廣場(chǎng)換1號(hào)線到中山北路站下。
●上海浦東國(guó)際機(jī)場(chǎng)距離酒店44.17公里;乘出租車約45分鐘,約160元可到酒店。坐2號(hào)地鐵到人民廣場(chǎng)換1號(hào)線到中山北路站下。
●上海火車站距離酒店2公里;乘出租車約5分鐘,約14元可到酒店。地鐵坐1號(hào)線到中山北路站下。
●上;疖嚹险揪嚯x酒店20公里;乘出租車約30分鐘,約60元可到酒店。地鐵坐1號(hào)線到中山北路站下。