10x Genomics技術(shù)方案更新(5月),新手冊(cè)邀您下載
瀏覽次數(shù):1726 發(fā)布日期:2025-6-13
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Chromium
使用 GEM-X Flex 基因表達(dá)試劑盒進(jìn)行 CRISPR 篩選 (CG000814, Rev A)
- 新技術(shù)文檔涵蓋了使用 GEM-X Flex 基因表達(dá)試劑盒進(jìn)行定制探針設(shè)計(jì)和進(jìn)行 CRISPR guide RNA捕獲檢測(cè)。
- 本文檔還提供了使用 GEM-X Flex 基因表達(dá)試劑盒進(jìn)行 CRISPR 篩選時(shí)所需的工作流程修改指導(dǎo),以及在 Cell Ranger 中分析 CRISPR 篩選和基因表達(dá)數(shù)據(jù)的指導(dǎo)。
GEM-X Flex 基因表達(dá)多重工作流程的板式樣品制備 (CG000817, Rev A)
- 在 96 孔 V 型底深孔板中制備樣品的新演示文檔,可實(shí)現(xiàn)最多 96 個(gè)樣品的高通量處理,以用于 GEM-X Flex 基因表達(dá)多重檢測(cè)工作流程。
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Visium
Visium HD 空間基因表達(dá)試劑盒用戶指南 (CG000685 Rev C)
- 儀器裝載指南中更新了組織載玻片裝載指南(第 35 頁(yè))
- 更新了 2.3 探針連接后清洗 (第 56 頁(yè)) 和 3.1 Visium HD 載玻片清洗 (第 60 頁(yè)) 中的 Visium HD 載玻片解凍時(shí)間范圍。
- 更新圖像和語(yǔ)言以強(qiáng)調(diào) 4.1 CytAssist 啟用探針釋放和捕獲部分的最佳實(shí)踐。
- 更新了 4.0 入門指南中的 2X RNase 緩沖液制備指南(第 64 頁(yè))。
Visium CytAssist 空間基因表達(dá)試劑盒 (CG000495 Rev G) 和 Visium CytAssist 空間基因和蛋白質(zhì)表達(dá)試劑盒 (CG000494 Rev E) 用戶指南
- 更新了儀器裝載指南部分中的組織載玻片裝載指南。
- 在 CytAssist-Enabled RNA 消化和組織去除部分中,更新了儀器裝載前組織載玻片擦拭指導(dǎo)。
- 在樣本索引部分添加了有關(guān)色彩平衡的信息。
- 在文庫(kù)加載部分添加了 NovaSeq X Plus 的加載濃度指導(dǎo)。
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Xenium
Xenium 儀器用戶指南 (CG000584 Rev H)
- 在軟件更新后添加儀器自檢測(cè)試步驟(第 39 頁(yè))
- 添加了使用 10x Genomics Cloud 進(jìn)行儀器監(jiān)測(cè)的說(shuō)明(第 75 頁(yè))
- 更新了 Xenium Prime 可接受的長(zhǎng)期存儲(chǔ)時(shí)間(第 89 頁(yè))
分析指南
- 利用標(biāo)記轉(zhuǎn)移技術(shù)在 Xenium 原位數(shù)據(jù)中注釋細(xì)胞類型
- 本分步教程演示了如何利用單細(xì)胞 RNA 測(cè)序數(shù)據(jù),通過(guò)標(biāo)簽轉(zhuǎn)移對(duì) Xenium In Situ 數(shù)據(jù)進(jìn)行注釋。教程包含詳細(xì)的說(shuō)明,涵蓋參考文獻(xiàn)選擇、數(shù)據(jù)集預(yù)處理、標(biāo)簽轉(zhuǎn)移、細(xì)胞標(biāo)簽預(yù)測(cè)評(píng)估以及導(dǎo)出注釋以在 Xenium Explorer 中查看。
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