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分析抗體在IFA實(shí)驗(yàn)中正常,但在WB實(shí)驗(yàn)中條帶多且雜的原因

瀏覽次數(shù):325 發(fā)布日期:2025-6-17  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
在免疫熒光實(shí)驗(yàn)(IFA)中能檢測(cè)到目標(biāo)信號(hào),但在 Western blot(WB)中出現(xiàn)條帶多且雜的現(xiàn)象,可能與實(shí)驗(yàn)體系差異、抗體特性、樣本處理或?qū)嶒?yàn)操作等多方面因素有關(guān)。以下從不同角度分析可能原因及解決建議:

一、抗體因素
1. 抗體特異性不足
原因:
單抗雖針對(duì)單一表位,但可能與樣本中其他蛋白存在交叉反應(yīng)(如同源蛋白、翻譯后修飾類似的蛋白)。
抗體生產(chǎn)過程中可能混有其他克隆抗體或雜質(zhì),導(dǎo)致非特異性結(jié)合。
解決方法:
更換高特異性的抗體,或通過預(yù)吸附實(shí)驗(yàn)(用目標(biāo)蛋白抗原預(yù)先吸附抗體,減少非特異性成分)優(yōu)化。
查看抗體說明書,確認(rèn)其適用的樣本類型(如是否經(jīng)過 WB 驗(yàn)證)。
2. 抗體濃度過高
原因:
抗體濃度過高會(huì)增加非特異性結(jié)合機(jī)會(huì),導(dǎo)致背景雜帶增多。
解決方法:
梯度稀釋抗體(如 1:500、1:1000、1:2000),通過預(yù)實(shí)驗(yàn)確定最佳稀釋比例。

二、樣本處理問題
1. 蛋白降解或修飾
原因:
樣本制備過程中未及時(shí)添加蛋白酶抑制劑,導(dǎo)致目標(biāo)蛋白降解為多種片段,形成多條帶。
目標(biāo)蛋白存在翻譯后修飾(如磷酸化、糖基化),不同修飾形式分子量不同,表現(xiàn)為多條帶。
解決方法:
裂解液中添加蛋白酶抑制劑 cocktail和磷酸酶抑制劑(如需檢測(cè)磷酸化蛋白)。
煮沸變性時(shí)確保充分(5-10 分鐘),避免蛋白聚集或降解。
2. 樣本成分復(fù)雜或雜質(zhì)多
原因:
組織樣本未充分勻漿,細(xì)胞碎片或核酸殘留干擾電泳和轉(zhuǎn)膜,導(dǎo)致條帶擴(kuò)散或雜帶。
樣本中存在與抗體 IgG 交叉反應(yīng)的成分(如 Fc 受體、類風(fēng)濕因子)。
解決方法:
優(yōu)化樣本制備流程,如增加超聲破碎或離心步驟(12000 rpm,15 分鐘)去除雜質(zhì)。
轉(zhuǎn)膜后用封閉液中添加 0.1% Tween-20增強(qiáng)洗滌效果,或使用 IgG 封閉劑(如 Anti-IgG Blocking Reagent)。

三、實(shí)驗(yàn)操作與條件優(yōu)化
1. 電泳與轉(zhuǎn)膜參數(shù)不當(dāng)
原因:
凝膠濃度不合適(如目標(biāo)蛋白分子量小但用高濃度膠,導(dǎo)致條帶拖尾或擴(kuò)散)。
轉(zhuǎn)膜時(shí)電流 / 電壓過高、時(shí)間過長(zhǎng),導(dǎo)致蛋白過度轉(zhuǎn)移或擴(kuò)散,形成雜帶。
解決方法:
根據(jù)目標(biāo)蛋白分子量選擇凝膠濃度(如 5-15% 梯度膠),確保條帶清晰分離。
優(yōu)化轉(zhuǎn)膜條件(如恒流 200 mA,90 分鐘;或低溫轉(zhuǎn)膜避免蛋白降解)。
2. 封閉不充分
原因:
膜上未結(jié)合蛋白的位點(diǎn)未被封閉劑充分覆蓋,導(dǎo)致抗體非特異性吸附。
解決方法:
更換封閉液類型:
常規(guī)蛋白樣本用 5% 脫脂奶粉(適用于非磷酸化蛋白)。
磷酸化蛋白用 5% BSA(避免奶粉中殘留的磷酸酶干擾)。
延長(zhǎng)封閉時(shí)間(室溫 1 小時(shí)或 4℃過夜),或提高封閉液濃度。
3. 洗滌不徹底
原因:
未充分洗去未結(jié)合的抗體或雜質(zhì),導(dǎo)致背景信號(hào)高。
解決方法:
增加洗滌次數(shù)(如每次 5 分鐘,共 4-5 次),或提高洗滌液中 Tween-20 濃度(0.1-0.5%)。
洗滌時(shí)使用搖床,確保膜充分接觸洗液。

四、目標(biāo)蛋白特性
1. 蛋白異構(gòu)體或剪切變體
原因:
目標(biāo)基因存在可變剪切或翻譯起始位點(diǎn)不同,產(chǎn)生多種分子量相近的異構(gòu)體,表現(xiàn)為多條帶。
解決方法:
查閱文獻(xiàn)確認(rèn)目標(biāo)蛋白的亞型,選擇針對(duì)保守區(qū)域的抗體。
用特異性引物通過 PCR 驗(yàn)證 mRNA 剪切形式,或用質(zhì)譜鑒定蛋白亞型。
2. 蛋白多聚體或聚集
原因:
蛋白在細(xì)胞內(nèi)形成多聚體(如二聚體、多聚體),或變性過程中發(fā)生聚集,電泳時(shí)表現(xiàn)為高分子量條帶。
解決方法:
裂解液中添加10-20 mM DTT 或 5% β- 巰基乙醇破壞二硫鍵,確保蛋白充分變性為單體。
避免反復(fù)凍融樣本,防止蛋白聚集。

五、對(duì)照實(shí)驗(yàn)缺失
建議:
增設(shè)陽性對(duì)照(已知表達(dá)目標(biāo)蛋白的細(xì)胞系)和陰性對(duì)照(敲除或未轉(zhuǎn)染目標(biāo)基因的樣本),排除抗體或操作問題。
使用預(yù)染 Marker監(jiān)控電泳和轉(zhuǎn)膜效率,確保條帶位置準(zhǔn)確。
總結(jié)排查流程
優(yōu)先優(yōu)化抗體:降低濃度或更換高特異性抗體,驗(yàn)證是否為抗體交叉反應(yīng)。
檢查樣本質(zhì)量:觀察裂解液是否澄清,檢測(cè)蛋白濃度和完整性(如跑膠觀察總蛋白條帶)。
調(diào)整實(shí)驗(yàn)條件:優(yōu)化封閉、洗滌、電泳和轉(zhuǎn)膜參數(shù),排除操作誤差。
分析蛋白特性:通過文獻(xiàn)或預(yù)實(shí)驗(yàn)確認(rèn)目標(biāo)蛋白是否存在多態(tài)性或修飾。
若問題仍未解決,可嘗試免疫沉淀(IP)-WB 聯(lián)用,先富集目標(biāo)蛋白再檢測(cè),以減少背景干擾。
發(fā)布者:費(fèi)雪(杭州)醫(yī)學(xué)研究有限公司
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