DNA甲基化研究的三大前期探索性實驗思路介紹
瀏覽次數(shù):686 發(fā)布日期:2023-3-29
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大家好,這里是專注表觀組學(xué)十余年,領(lǐng)跑多組學(xué)科研服務(wù)的易基因。
近些年以來,DNA甲基化研究一直是頂級期刊、基金資助、臨床研究、藥物研發(fā)上市的多重?zé)狳c,其研究方向涵蓋疾病發(fā)生發(fā)展、疾病標(biāo)志物研究、環(huán)境因素暴露與響應(yīng)、發(fā)育和分化等多維度。
研究人員為DNA甲基化課題申請作準(zhǔn)備以及為降低DNA甲基化實驗風(fēng)險,通常會進行DNA甲基化研究的前期探索性實驗,主要包括:
- 檢測DNA甲基化酶和去甲基化酶的表達
- 檢測整體DNA甲基化水平變化
- 其他前期實驗
一、檢測DNA甲基化酶和去甲基化酶的表達
方法包括:
- RT-qPCR檢測mRNA表達
- Western blot檢測蛋白質(zhì)翻譯
e.g. 高脂飲食組和肥胖人群中均觀察到DNMT的RNA和蛋白質(zhì)表達上調(diào)
二、檢測整體DNA甲基化水平變化
方法包括:
² 5mC甲基化免疫熒光染色(定性)
² DNA斑點雜交(定性)
² 比色法(定量)
² 質(zhì)譜法(定量)
斑點雜交(Dot blot)
免疫熒光顯微觀察
比色法/質(zhì)譜法
三、其他前期實驗
在沒有條件開展甲基化相關(guān)前期實驗的情況下,也可以開展其他預(yù)實驗。包括:
² 關(guān)鍵表型指標(biāo)測定
² 轉(zhuǎn)錄組(成本低廉)
在進行前期探索性實驗后,DNA甲基化的研究思路與項目設(shè)計還包括:技術(shù)選擇、數(shù)據(jù)挖掘、下游驗證。