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ComplexHeatmap包繪制密度熱圖的參數(shù)調(diào)整和添加注釋方法

瀏覽次數(shù):276 發(fā)布日期:2025-6-12  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
在展示多樣本數(shù)據(jù)分布時,除了箱型圖和小提琴圖,密度熱圖也是一個不錯的選擇。下面我們就來了解一下ComplexHeatmap包繪制出的密度熱圖。
 
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01 密度熱圖介紹 

密度熱圖中每列為一個樣本,顏色體現(xiàn)密度,越接近深紅色密度越高,深藍(lán)色為密度低。五條黑色虛線分別對應(yīng)了五個分位,紅色虛線為均值。

02 參數(shù)調(diào)整 

修改y軸范圍 

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修改色階 

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樣本聚類 

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添加列注釋 

下圖在上方添加了顏色條,用于區(qū)分樣本分組,下方添加了散點圖注釋。

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03 添加為熱圖列注釋 

密度熱圖不僅可以添加列注釋,也可以作為列注釋添加在常規(guī)熱圖的上方或下方。下圖添加了兩個列注釋,第一個是密度熱圖,用于展示樣本表達(dá)值的分布情況;第二個是柱狀圖,用于展示每個樣本中某指標(biāo)的高低。

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發(fā)布者:上海生物芯片有限公司
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