芯片靶向捕獲和重測(cè)序技術(shù)加快新一代測(cè)序速度

北京2009年7月--來(lái)自冷泉港實(shí)驗(yàn)室（CSHL）和安捷倫科技公司（NYSE: A）的研究小組，共同開發(fā)了針對(duì)新一代大規(guī)模平行DNA測(cè)序技術(shù)的補(bǔ)充方案，使用定制芯片對(duì)感興趣的基因組區(qū)域進(jìn)行靶向捕獲。該方法發(fā)表在Nature Protocols （vol.4, No.6）上，從芯片捕獲到Illumina Genome Analyzer的分析，通常只須9到10天即可完成。

“通過(guò)定制芯片上的雜交選擇進(jìn)行靶向重測(cè)序，為解決眾多遺傳問(wèn)題（包括腫瘤遺傳學(xué)）提供了直接而經(jīng)濟(jì)的策略，”論文的第一作者， CSHL研究員Emily Hodges博士說(shuō)，“便捷的芯片，結(jié)合現(xiàn)成的試劑，構(gòu)成了一個(gè)便于使用的重測(cè)序平臺(tái)，可針對(duì)研究者各自感興趣的課題重新配置。 ”

“我們很榮幸能與CSHL Gregory Hannon博士的實(shí)驗(yàn)室合作，”合作作者，安捷倫生命科學(xué)部 Andy Bhattacharjee博士說(shuō)，“芯片捕獲技術(shù)簡(jiǎn)便、適用性好、耐用性高，有效解決了新一代測(cè)序在樣品制備上存在的瓶頸問(wèn)題。而且，芯片設(shè)計(jì)具有高度的可定制性和簡(jiǎn)便性，可適用于對(duì)其它已知序列真核生物基因組進(jìn)行靶向捕獲。”

閱讀全文，“Hybrid selection of discrete genomic intervals on custom-designed microarrays for massively parallel sequencing”可鏈接 www.nature.com/nprot/journal/v4/n6/full/nprot.2009.68.html （需訂閱）。