【網絡講座】蛋白質譜鑒定軟件Mascot 2.6新功能介紹

講座內容簡介：

Mascot是Matrix Science公司開發(fā)的蛋白組學質譜數(shù)據(jù)分析專業(yè)軟件，是目前主流的蛋白質譜分析搜索引擎，是蛋白質組學質譜鑒定的行業(yè)標準軟件。

2016年12月，Mascot server正式發(fā)布了2.6新版本。另外，在剛剛結束的美國質譜年會（ASMS）上，Mascot Server繼續(xù)發(fā)布了2.6.1版本的技術更新。

以下是本次網絡講座的課程內容及時間安排，機會只有一次，不要錯過哦��！

講座時間：2017/7/14(周五) 下午3 : 00-4：30

主辦單位：上�？店攀⑿畔⒖萍加邢薰�司

主講人：李文婷 | 生物信息學部 | 技術工程師

本次網絡課堂圍繞Mascot Server2.6的新功能進行詳細介紹，主要包括以下內容：

Search engine

• 去除了原有在采用多數(shù)據(jù)庫聯(lián)合搜庫時，對數(shù)據(jù)庫必須是同一類型的限制，
• 該版本最大的更新是可以綜合利用NIST MSPepSearch進行譜圖庫搜索。

報告中一些算法的修改

• Percolator提升到3.0版本，將 Percolator 的計算擴展到所有等級。
• 擴展了FDR的計算，不僅基于PSM計算FDR，同時可以對Peptide Sequence 數(shù)目進行FDR計算。
• 報告¹³C的校正后的質量增差

Mascot Daemon的更新 

• 導出和導入工作任務數(shù)據(jù)庫
• 直接提交搜庫任務
• 更好地展示狀態(tài)信息
• 搜索任務連續(xù)運行
• 狀態(tài)的樹狀圖信息過濾
• 自動導出XML格式定量結果
• 更靈活的數(shù)據(jù)導入過濾

Administration

• Perl的“私人化”副本
• Database Manager支持譜圖庫
• 有計劃地刪除過去的緩存文件，釋放磁盤空間
• 從數(shù)據(jù)庫狀態(tài)中提供鏈接用于數(shù)據(jù)庫再壓縮
• 在ms-review 中設置默認展示的列

利用譜圖庫對蛋白鑒定

• 搜庫參數(shù)設置
• 結果報告
• 參考數(shù)據(jù)庫
• 打分與統(tǒng)計
• 數(shù)據(jù)庫配置

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關于Mascot

Mascot是針對質譜數(shù)據(jù)，利用蛋白質序列數(shù)據(jù)庫、譜圖數(shù)據(jù)庫比對檢索的方法來鑒定樣本中蛋白質定性、定量以及翻譯后修飾的行業(yè)標準軟件。Mascot可以支持并能夠嵌入目前絕大多數(shù)的質譜系統(tǒng)進行質譜數(shù)據(jù)的分析解讀，包括AB Sciex、Agilent、Bruker、Jeol、Shimadzu、Thermo Scientific、Waters等蛋白質譜儀。Mascot Server是質譜數(shù)據(jù)處理的核心軟件，架設在基于HTTP的網絡服務中，可以支持從本地或網上提交任意數(shù)量的譜圖進行搜庫鑒定和定量。同時Mascot提供了一個自動化、標準化的數(shù)據(jù)庫上傳管理、數(shù)據(jù)結果解讀、導出方案。幫助您不但可以構建面向各質譜儀的數(shù)據(jù)分析平臺，同時可以向整個學校的用戶提供在線的分析結果查看和報告輸出服務。