講座背景:
最近Vevo Therapeutics聯(lián)合Parse Biosciences等團(tuán)隊共同發(fā)布了Tahoe-100M,這是目前全球規(guī)模最大的癌癥單細(xì)胞藥物擾動數(shù)據(jù)集。該數(shù)據(jù)集包含1.006億個高質(zhì)量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組細(xì)胞,覆蓋50種癌細(xì)胞系、1100+藥物擾動。現(xiàn)在Tahoe-100M數(shù)據(jù)集已經(jīng)集成到Talk2Data中。
在當(dāng)今生物醫(yī)學(xué)研究中,多組學(xué)數(shù)據(jù)整合和分析已成為理解復(fù)雜生物系統(tǒng)的重要手段。如何高效管理和利用這些龐大的數(shù)據(jù)集,將是一個巨大的挑戰(zhàn)。
Talk2Data是一個GPU加速的公共單細(xì)胞數(shù)據(jù)探索平臺,包含512M+細(xì)胞?茖W(xué)家可以利用Talk2Data數(shù)據(jù)庫實時整合多個數(shù)據(jù)集,并進(jìn)行下游分析,包括稀有細(xì)胞群體的組成、差異表達(dá)、通路富集、相關(guān)性和marker基因鑒定。目前,來自100多家制藥公司的科學(xué)家正在使用該平臺來提出假設(shè)、確定靶標(biāo)和加速生物發(fā)現(xiàn)。
為了更好的了解Talk2Data的功能,我們將舉辦一場線上講座,介紹如何利用Talk2Data進(jìn)行跨研究分析:
如何快速找到感興趣的單細(xì)胞數(shù)據(jù)集?
如何創(chuàng)建個性化的單細(xì)胞圖譜?
探索感興趣的基因在不同的細(xì)胞類型、組織或者疾病中的表達(dá)
哪些細(xì)胞類型在疾病狀態(tài)下高度表達(dá)某種基因?
探索兩種疾病的細(xì)胞類型組成的差異
哪些基因與特定基因共表達(dá)?
如何識別區(qū)分不同細(xì)胞類型的Marker基因?
與健康狀態(tài)相比,疾病中哪些基因上調(diào)/下調(diào)?
BBrowserX能夠高效管理和可視化單細(xì)胞數(shù)據(jù),實現(xiàn)界面化交互探索分析,包括AUCell富集,差異表達(dá)及熱圖分析,通路富集,擬時序分析,細(xì)胞通訊,子聚類和亞型分析等。
講座詳情:
▶ 本次線上講座將由上?店攀⒌膽(yīng)用工程師Xander Wei主持,他將展示Talk2Data單細(xì)胞數(shù)據(jù)庫的強(qiáng)大功能,并通過實際案例分享如何探索Tahoe-100M中的藥物擾動數(shù)據(jù)。
▶ 為保證培訓(xùn)效果,名額有限,大家盡早報名!
講座時間:
▶ 6月19日(周四)15:00-16:00
報名方式:
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