百趣生物年度重磅升級(jí)：發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué)HD

近日，我們針對(duì)親水和MIX兩大體系完成了升級(jí)，隨機(jī)對(duì)血清、尿液、動(dòng)物組織、植物組織等多種樣本類型進(jìn)行了實(shí)測(cè)。
升級(jí)后的「發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué)HD-親水版」，物質(zhì)檢出數(shù)量平均為升級(jí)前的241%，物質(zhì)定性數(shù)量為139%。以人血清樣本為例，物質(zhì)檢出數(shù)量平均提升了96%，物質(zhì)定性數(shù)量平均提升了29%。
 

升級(jí)后的「發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué)HD-MIX版」，物質(zhì)檢出數(shù)量平均為升級(jí)前的193%，物質(zhì)定性數(shù)量為134%。以小鼠血清樣本為例，物質(zhì)檢出數(shù)量平均提升57%，物質(zhì)定性數(shù)量平均提升75%。
 

B(i)級(jí)別可靠鑒定代謝物20%
配合最新優(yōu)化升級(jí)的數(shù)據(jù)庫(kù)，參考2021年最新NATURE METHODS（IF=28.547）^[1]對(duì)代謝物的鑒定級(jí)別進(jìn)行了注釋，「發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué)HD」系列產(chǎn)品各種類型樣本B(i)級(jí)別鑒定代謝物平均占比可達(dá)到20%�；�于非靶向技術(shù)的核心優(yōu)勢(shì)，隨著數(shù)據(jù)庫(kù)的迭代升級(jí)，可以對(duì)已檢出的數(shù)據(jù)進(jìn)行反復(fù)挖掘，對(duì)未知物進(jìn)行更深度的注釋及提高物質(zhì)鑒定的可靠性。
(P.S.BIOTREE對(duì)「發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué)HD」系列產(chǎn)品提供免費(fèi)數(shù)據(jù)再次挖掘服務(wù))
 

發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué)HD兩大升級(jí)

1. 儀器性能的提升
使用Thermo Orbitrap Exploris 120高分辨質(zhì)譜儀器平臺(tái)，在性能和質(zhì)量精度方面都有很大提升，從而采集到更多的代謝物信號(hào)。
 

2.數(shù)據(jù)庫(kù)的升級(jí)
為了充分利用代謝組學(xué)數(shù)據(jù)，我們需要在不同的實(shí)驗(yàn)室之間進(jìn)行可比性�？紤]到不同技術(shù)手段產(chǎn)出的數(shù)據(jù)存在差異，在發(fā)表的論文中，需要標(biāo)明物質(zhì)注釋的相關(guān)信息，其中代謝物注釋的可靠等級(jí)尤為重要，BIOTREE對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行了全面的升級(jí)提供了代謝物注釋的分類等級(jí)，「發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué)HD」系列產(chǎn)品可以提供達(dá)到B(i)級(jí)別的代謝物鑒定。

參考上文提到的NATURE METHODS建議，代謝物鑒定級(jí)別：
A 標(biāo)準(zhǔn)品靶向驗(yàn)證或NMR鑒定
B(i) 基于標(biāo)品數(shù)據(jù)庫(kù)MS/MS 的可靠匹配
B(ii) 基于模擬數(shù)據(jù)庫(kù) MS/MS 的可靠匹配
B(iii) 基于MS/MS 的部分匹配
C(i ) 基于標(biāo)品數(shù)據(jù)庫(kù)MSn 的可靠匹配
C(ii) 基于模擬數(shù)據(jù)庫(kù) MSn 的可靠匹配
C(iii) 基于 MSn 的部分匹配
D 基于MS的匹配

參考文獻(xiàn)
[1] Alseekh S, Aharoni A, Brotman Y, et al. Mass spectrometry-based metabolomics: a guide for annotation, quantification and best reporting practices. Nat Methods. 2021 Jul;18(7):747-756. doi: 10.1038/s41592-021-01197-1. Epub 2021 Jul 8. PMID: 34239102.