454(GS FLX系統(tǒng))超高通量測序

    羅氏 公司的454 測序技術(shù)為廣大用戶提供了強(qiáng)大的下一代測序方法，為目前遺傳分析和功能基因組等熱門研究領(lǐng)域的部分熱門課題提出了全新的應(yīng)用方案。我公司與美國Creative Dynamics Inc公司協(xié)作開展454測序技術(shù)服務(wù)。

• 重測序項目

  隨著測定基因組物種的增多，重測序成本越來越低，我們必將迎來一個重測序的時代。新一代DNA測序技術(shù)454大大降低了基因組重測序的成本，同時極大提高了測序效率。重測序1億個堿基的費(fèi)用為17萬人民幣，時間為3周。

• De Novo Sequencing 服務(wù)介紹

  獲得一個物種的全基因組序列是加快對此物種了解的重要捷徑。隨著新一代測序技術(shù)的飛速發(fā)展，大規(guī)模基因組測序漸入佳境，基因組學(xué)研究也迎來新的發(fā)展契機(jī)和革命性突破。454技術(shù)以平均序列讀長270bp遙遙領(lǐng)先于同系列高通量測序儀，而序列平均讀長在基因組測序拼接過程中至關(guān)重要。該技術(shù)的突破將引發(fā)新的基因組測序熱潮，為搭建種質(zhì)基因組學(xué)平臺和推動基因組學(xué)研究帶來新的動力。

  基因組大小	草圖報價	草圖耗時	完成圖報價	完成圖耗時
  1M±0.5M	7萬	3周	7萬	3月
  3M±0.5M	13萬	3周	13萬	3～5月
  6M±1M	13萬	3周	15萬	4～7月

   

• 基本信息分析：圖像識別，basecalling，過濾接頭序列，檢測可能的樣品污染。

收費(fèi)：此項服務(wù)免費(fèi)

• 高級信息分析
  • 基因組注釋：包括基因組組分分析、基因預(yù)測、重復(fù)序列注釋、Non-coding RNA預(yù) 測和假基因（Pseudogene）注釋等。收費(fèi)：1萬元人民幣
  • 基因的功能注釋及分類: 通過比對軟件（Blast系列軟件包）與公共數(shù)據(jù)中序列做同源性聯(lián)配，在保證嚴(yán)格置信度標(biāo)準(zhǔn)前提下，對基因進(jìn)行功能注釋。最全面數(shù)據(jù)庫的使用，保證所得數(shù)據(jù)與國際同步，最大限度挖掘基因組信息。

  收費(fèi)：1.2萬元人民幣

  • 比較基因組及分子進(jìn)化分析 序列同源比對、通過相鄰物種的比較基因組研究進(jìn)行進(jìn)化分析、基因注釋、功能分類等

  1) 共線性分析（Synteny）

  2) 基因家族聚類（Gene Family Clustering）

  3) 同源性分析（Orthology）

  4) 分子進(jìn)化分析（Molecular Evolution）

  收費(fèi)：1.2萬元人民