質(zhì)譜MRM（多反應監(jiān)測）與iTRAQ/TMT定量方法分析對比

1.引言

生物藥物研究領(lǐng)域中，蛋白質(zhì)定量是一項重要的任務。準確地測量蛋白質(zhì)的表達水平對于了解疾病機制、藥物研發(fā)以及生物標記物的發(fā)現(xiàn)具有關(guān)鍵意義。在蛋白質(zhì)組學研究中，質(zhì)譜技術(shù)是一種常用的方法。本文將重點介紹質(zhì)譜MRM（多反應監(jiān)測）與iTRAQ/TMT定量兩種常見的蛋白質(zhì)組學定量方法，并對其進行對比分析。
 

2.質(zhì)譜MRM定量

質(zhì)譜MRM是一種基于質(zhì)譜技術(shù)的定量方法，它通過選擇特定的肽段和轉(zhuǎn)換反應離子對（transition）來實現(xiàn)對目標蛋白質(zhì)的定量。首先，通過質(zhì)譜技術(shù)對樣品進行分析，獲得肽段的質(zhì)譜譜圖。然后，選擇特定的肽段和其對應的轉(zhuǎn)換反應離子對進行監(jiān)測。通過測量這些離子對的峰面積，可以推斷出目標蛋白質(zhì)的含量。

質(zhì)譜MRM定量方法具有高靈敏度、高選擇性和高通量的特點。它可以同時監(jiān)測多個肽段，從而實現(xiàn)對多個蛋白質(zhì)的定量。此外，質(zhì)譜MRM定量方法還可以通過穩(wěn)定同位素標記技術(shù)（如15N標記）來實現(xiàn)絕對定量，提高定量結(jié)果的準確性。
 

3.iTRAQ/TMT定量

iTRAQ（同位素標記化反應標記）和TMT（同位素標記化標記）是兩種常用的蛋白質(zhì)組學定量方法。它們通過在樣品中引入特定的同位素標記化試劑，將不同樣品的蛋白質(zhì)進行標記，然后將標記的樣品混合在一起進行質(zhì)譜分析。

iTRAQ和TMT定量方法具有高通量、高復現(xiàn)性和高靈敏度的特點。它們可以同時定量多個樣品，從而實現(xiàn)高通量的蛋白質(zhì)組學研究。此外，iTRAQ和TMT定量方法還可以通過選擇性地標記特定的氨基酸殘基（如精氨酸和賴氨酸）來實現(xiàn)定量的精確性。

4..質(zhì)譜MRM與iTRAQ/TMT定量的對比

質(zhì)譜MRM和iTRAQ/TMT定量方法在蛋白質(zhì)組學研究中都具有重要的應用價值，但它們也存在一些差異。

首先，質(zhì)譜MRM定量方法具有更高的靈敏度和選擇性。它可以選擇性地監(jiān)測目標肽段，從而避免了復雜樣品中其他干擾物質(zhì)的影響。相比之下，iTRAQ/TMT定量方法需要對整個樣品進行質(zhì)譜分析，可能會受到復雜樣品基質(zhì)的干擾。

其次，質(zhì)譜MRM定量方法適用于定量少量目標蛋白質(zhì)的情況。它可以選擇性地監(jiān)測目標肽段，從而實現(xiàn)對少量目標蛋白質(zhì)的定量。相比之下，iTRAQ/TMT定量方法適用于同時定量多個樣品的情況，但對于少量目標蛋白質(zhì)的定量可能不夠準確。

最后，質(zhì)譜MRM定量方法可以實現(xiàn)絕對定量，提高定量結(jié)果的準確性。通過穩(wěn)定同位素標記技術(shù)，可以將質(zhì)譜MRM定量結(jié)果與已知濃度的標準品進行比較，從而實現(xiàn)絕對定量。相比之下，iTRAQ/TMT定量方法只能實現(xiàn)相對定量，無法得到絕對定量結(jié)果。

5.結(jié)論

質(zhì)譜MRM和iTRAQ/TMT定量方法是生物藥物研究領(lǐng)域中常用的蛋白質(zhì)組學定量方法。質(zhì)譜MRM定量方法具有高靈敏度、高選擇性和高通量的特點，適用于定量少量目標蛋白質(zhì)的情況。iTRAQ/TMT定量方法具有高通量、高復現(xiàn)性和高靈敏度的特點，適用于同時定量多個樣品的情況。在選擇定量方法時，需要根據(jù)實驗的具體需求和樣品特點進行選擇。

圖1