芯空一號實現(xiàn)的單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組檢測數(shù)據(jù)

Visium空間轉(zhuǎn)錄組測序，作為第一個商業(yè)化的空間轉(zhuǎn)錄組檢測平臺，這些年來極大地促進(jìn)了空間組學(xué)的發(fā)展，也助力了很多高影響因子研究成果的發(fā)表。然而，第一代產(chǎn)品55μm尺度，OCT冷凍樣本的實驗方案，還是影響了大量臨床石蠟樣本的檢測；第二代CytAssist平臺的升級，不光實現(xiàn)了對石蠟組織樣本的拓展，也解決了樣本用普通玻璃片貼片再進(jìn)行運送的問題；第三代Visium HD產(chǎn)品的升級，再次突破了檢測分辨率的局限，直接從55μm提高了到2μm分辨率。雖然從分辨率上來說，2μm的大小遠(yuǎn)小于單個細(xì)胞的直徑，但是從分析角度來說，由于沒有更多的方法協(xié)助，還是做不到單個細(xì)胞的分辨率。如果有人跟你說，HD就是單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組檢測，放心，他絕對在忽悠人。

然而，要想實現(xiàn)HD數(shù)據(jù)單細(xì)胞空間分辨率的夢想還是要有的，這會兒還真能實現(xiàn)了。利用上機樣本的HE染色圖片，結(jié)合數(shù)據(jù)2μm尺度的分辨率，我們用新的算法軟件，實現(xiàn)了對HD數(shù)據(jù)進(jìn)行細(xì)胞分割的想法。終于，在這個動蕩混亂的時代，我們還是在艱苦奮斗中有了一點小的突破。終于，在AI智能時代來臨之際，全轉(zhuǎn)錄組單細(xì)胞分辨率的Visium空間產(chǎn)品問世了。

讓我們一起來看一下HD數(shù)據(jù)實現(xiàn)的單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)：

分析一